尤其各高等院校。学部及其下属的各级教谕、督学、学正不能轻易干涉学校的正常运作和管理，而各级学校的经费除了学部下拨之外，还有一部分依靠社会捐助。除此之外学部还管理着北府所有书籍报刊的审阅出版等事宜。
户部掌天下财政，包括钱粮赋税、计度支纳、蠲免库储等等，说白了就是北府的财政部。
礼部掌礼仪、祭享、外交和宗教。也就是负责制定礼仪，进行先贤先烈的追认和祭祀，并概括了对外诸国交际事务，除此之外还要负责管理天文、漏刻、国忌、庙讳、僧尼等诸多事务。
工部掌北府所有的工场、矿山、研制所和工务院校，差不多等于机械部加能源部加煤炭部。
商部掌北府内外商贸，负责管理所有的商社和商行，还要负责制订内外贸易中各种商品的税率，监管和控制各种物品的贸易和进出口，尤其是茶、盐、铁等重要物资。曾华是按照“异世”的商务部来设置的。
农部掌北府的农、林、牧各类产业。负责劝农、垦荒、种伐、畜牧、渔产等事务。在曾华的心目中，是“异世”中的农业部、林业部等部门的大混合。
治部掌北府的土木水利工程，无论是城池、道路、桥梁、堤堰等等的修筑，都由治部负责，应该算是北府的建设部。
民政部掌北府的所有户籍，田土分配，婚姻继嗣以及医药卫生、赈灾济贫等与百姓日常生活息息相关的事务。曾华把自己知道的“异世”中的民政部、社会保障部、卫生部等诸多部门职责全部混合在一起，成立了这么一个部门。
法务部是一个让北府上下比较费解的部门。曾华给它定义的职责是督行国家律法。它有两个下属机构非常有名，一个是检察总署，一个是巡警总署。
检察总署的职责是检刑监察，细分下来一是检刑诉讼，也就是与巡警总署配合，侦缉刑事案件，而且两者相互监督制衡。巡警部门接到报案或者是巡查到刑事案件，按律立即出警，立案侦查。一旦发现罪犯和证据，就会向检察官申报，由检察官批准缉捕，再完成审讯和收集足够的证据，最由检察官向裁判所起诉，进行刑事审判。
二是察司法之非，监督裁判所审理案件是否公正，一旦不公，可以向上一级检察官和裁判所申述。从后两个职责来看，曾华把这个检察总署按“异世”的检察院来设置，而检察总署和各地的各级机构不设主官，只是设各级检察官若干，分巡各地，各视一方，**行使职权。如果有案件牵涉重复或互悖冲突，则由三名以上检察官合议裁决。
检察总署设九名大检察官，州检察署设九以上州检察官，均由由法务部主官提名任命，郡检察署设十五名以上郡检察官，由大检察官合议任命，县检察署设十五名以上县县检察官，由州检察官任命。
检察官还有一个最重要的职责，就是以参劾权监察行政事务，督视纠正各级政务之非，算得上是尚书行省内部的监察部门。如县检察官发现县巡警署不作为，为向县令通报，责其改正。如不听，则行使参劾权，向上级的郡检察署参劾。主管的郡检察官接到参劾后立即向郡守通报，建议其指令下级改正。不听，郡检察官继续行使参劾权，州检察官接到参劾后，会向州刺史通报建议。如还不听，州检察官会向大检察官参劾。
一旦大检察官核准了，参劾就变成了弹劾。这个时候平章国事只有两个选择，一是接受弹劾，追究从州到县所有相关官员的责任；二是驳回弹劾，将提出弹劾的大检察官解职。但是这个时候平章国事就要承担风险和任何。因为这个时候按律都察院会介入，一旦在中书行省通过了弹劾案，除了要追究地方相关官员的责任外，平章国事也要跟着吃挂落。
巡警总署就很明白，曾华把当成“异世”的公安部来设置，只是剥夺了一些权力，只留下了维持治安，侦查案件等执法权力了。各地设各级巡警署，接受巡警总署和地方官府的“双重领导”。
转运部掌北府的道路、桥梁、渡口、舟桥的维护，负责转运各地的物资，还有邮传驿站和漕运等等，算得上是古代版的交通部。
陆军部掌北府陆军武官的录选、调迁、升降、授职及征募兵籍、关禁、粮饷、辎重等事务，并掌管所有生产陆军所用军械物资的工场。
海军部掌北府海军武官的录选、调迁、升降、授职及兵籍、关禁、粮饷、辎重等事务，并掌管所有生产陆军所用军械物资的工场和造船厂。
为表示北府的尚书行省的级别比江左尚书省要低，曾华在各部不设尚书，而只是以侍郎之职加判各部事务的衔为各部主官。如荣野王以判陆军部事务侍郎的身份主掌陆军部，钱富贵以判户部事务侍郎的身份掌户部。
而平掌国事当任不让的由王猛出任，参知政事分别是笮朴和张寿。
但是曾华却另外玩了一手，他给平章国事、参知政事和几个重要部门如户部、法务部、陆军部、海军部的侍郎加了个录尚书事名号，以便组成一个国事会议，处理北府所有的行政事务。由于召开国事会议的地方被曾华提名国事内阁，所以这个“领导班子”也被世人称之“内阁”。按照曾华的说法，北府国事，无论巨细，皆委决于内阁。
曾华这样一手，搞得江左和桓温苦笑不已。按照晋制，录尚书事就是尚书省所有的公文决策都必须经由他之手，所以可以说是大晋的宰相。但是曾华却加了一大堆的录尚书