箱子里装船运往日本。
这部分书籍和文稿一部分用来建立东京的东亚研究所，东方文化研究所，东亚经济研究所，大东亚图书馆等其他研究机构。
这些文化财富被存放在日本皇宫、皇室宫内厅、靖国神社、早稻田大学、东京帝国大学和庆应大学等地方，虽然战后中国学者要求归还，但是这些书籍超多三百万册，日本人只归还了十六万册，不到百分之六。